Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms