Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD1Q9Y239 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOD1Q9Y239 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms