Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms