Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS5Q9UPZ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPS5Q9UPZ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms