Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AGTPBP1Q9UPW5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms