Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF24Q9UPV7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms