Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SORCS3Q9UPU3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS3Q9UPU3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms