Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHF8Q9UPP1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms