Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms