Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FZD1Q9UP38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms