Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PADI3Q9ULW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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