Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH7Q9ULB5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms