Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC9Q9UKV0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms