Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms