Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD2Q9UKL4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms