Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms