Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRTO4Q9UKD2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms