Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH22Q9UJ99 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH22Q9UJ99 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms