Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms