Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATPIF1Q9UII2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATPIF1Q9UII2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms