Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms