Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SS18L2Q9UHA2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SS18L2Q9UHA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms