Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRDQ9UH36 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRRDQ9UH36 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms