Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT8Q9UFF9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms