Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms