Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM10Q9UDY6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM10Q9UDY6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms