Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSFQ9UBX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSFQ9UBX1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms