Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS7AQ9UBW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms