Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK4Q9UBT3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK4Q9UBT3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms