Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363 ms