Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPASTQ9UBP0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms