Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL13Q9P2N7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms