Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNQ9P2M7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGNQ9P2M7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms