Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RRBP1Q9P2E9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RRBP1Q9P2E9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms