Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN3Q9P232 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms