Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC45.19■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
CCDC180Q9P1Z9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CCDC180Q9P1Z9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC45.07■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms