Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms