Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXXC1Q9P0U4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms