Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCMF1Q9P0J7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms