Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOFQ9NZM1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms