Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD3Q9NYL9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD3Q9NYL9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms