Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR4Q9NYA4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR4Q9NYA4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR4Q9NYA4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms