Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms