Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN2AIPQ9NXV6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms