Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3BQ9NW08 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3BQ9NW08 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms