Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms