Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SAMSN1Q9NSI8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms