Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A13Q9NSD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms