Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOMER2Q9NSB8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOMER2Q9NSB8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms