Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHPT1Q9NRX4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms